MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p5

Total Repeats: 13430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016624	CAG	2	6	463204	463209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294463
13002	NC_016624	GAC	2	6	463237	463242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294463
13003	NC_016624	GGC	2	6	463243	463248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294463
13004	NC_016624	GCC	3	9	463271	463279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294463
13005	NC_016624	CGGT	2	8	463316	463323	0 %	25 %	50 %	25 %	374294463
13006	NC_016624	GGA	2	6	463347	463352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294463
13007	NC_016624	TCG	2	6	463432	463437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_016624	GTGC	2	8	463494	463501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13009	NC_016624	CCGGC	2	10	463535	463544	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13010	NC_016624	CGG	2	6	463545	463550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_016624	G	6	6	463568	463573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_016624	TCA	2	6	463600	463605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_016624	CCG	2	6	463769	463774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_016624	CGG	2	6	463907	463912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_016624	CGC	2	6	463939	463944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13016	NC_016624	C	6	6	463944	463949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13017	NC_016624	G	6	6	463961	463966	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_016624	CCA	2	6	464033	464038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294464
13019	NC_016624	GAC	4	12	464040	464051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13020	NC_016624	CAG	2	6	464052	464057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13021	NC_016624	TCG	2	6	464066	464071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13022	NC_016624	CGG	2	6	464092	464097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13023	NC_016624	CGA	2	6	464126	464131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13024	NC_016624	CGG	2	6	464135	464140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13025	NC_016624	CGC	2	6	464199	464204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13026	NC_016624	CGG	2	6	464231	464236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13027	NC_016624	CAT	2	6	464256	464261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294464
13028	NC_016624	CGG	2	6	464300	464305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13029	NC_016624	CCG	2	6	464308	464313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13030	NC_016624	TGCC	2	8	464361	464368	0 %	25 %	25 %	50 %	374294464
13031	NC_016624	CGC	2	6	464376	464381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13032	NC_016624	CCG	2	6	464383	464388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13033	NC_016624	GGC	2	6	464403	464408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13034	NC_016624	CGA	2	6	464414	464419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13035	NC_016624	GGC	2	6	464430	464435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13036	NC_016624	GC	3	6	464452	464457	0 %	0 %	50 %	50 %	374294464
13037	NC_016624	ACC	2	6	464470	464475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294464
13038	NC_016624	CGCC	2	8	464477	464484	0 %	0 %	25 %	75 %	374294464
13039	NC_016624	GGC	2	6	464487	464492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13040	NC_016624	CAG	2	6	464505	464510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13041	NC_016624	GGC	2	6	464514	464519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13042	NC_016624	CAC	2	6	464523	464528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294464
13043	NC_016624	GCA	2	6	464549	464554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13044	NC_016624	CCG	2	6	464572	464577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13045	NC_016624	CCAG	2	8	464591	464598	25 %	0 %	25 %	50 %	374294464
13046	NC_016624	GCG	2	6	464618	464623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13047	NC_016624	GCA	2	6	464624	464629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13048	NC_016624	GCG	2	6	464647	464652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13049	NC_016624	CAG	2	6	464655	464660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13050	NC_016624	CGCCAT	2	12	464691	464702	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294464
13051	NC_016624	CGT	2	6	464711	464716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13052	NC_016624	GCA	2	6	464723	464728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13053	NC_016624	CCA	2	6	464741	464746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294464
13054	NC_016624	CGC	2	6	464774	464779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13055	NC_016624	CGA	2	6	464792	464797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13056	NC_016624	CAGA	2	8	464826	464833	50 %	0 %	25 %	25 %	374294464
13057	NC_016624	AGG	2	6	464836	464841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294464
13058	NC_016624	GCA	2	6	464912	464917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13059	NC_016624	GGCAG	2	10	464918	464927	20 %	0 %	60 %	20 %	374294464
13060	NC_016624	CAG	2	6	464940	464945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13061	NC_016624	GCC	2	6	465028	465033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
13062	NC_016624	CTGA	2	8	465039	465046	25 %	25 %	25 %	25 %	374294464
13063	NC_016624	GCG	2	6	465058	465063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13064	NC_016624	CGG	2	6	465072	465077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13065	NC_016624	GCA	2	6	465092	465097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13066	NC_016624	GACC	2	8	465152	465159	25 %	0 %	25 %	50 %	374294464
13067	NC_016624	CGA	2	6	465170	465175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13068	NC_016624	GC	3	6	465181	465186	0 %	0 %	50 %	50 %	374294464
13069	NC_016624	CGG	2	6	465187	465192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13070	NC_016624	CGG	3	9	465206	465214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13071	NC_016624	CAG	2	6	465249	465254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
13072	NC_016624	CGG	2	6	465257	465262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294464
13073	NC_016624	GAT	2	6	465264	465269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294464
13074	NC_016624	GCCA	2	8	465286	465293	25 %	0 %	25 %	50 %	374294464
13075	NC_016624	CGCC	2	8	465302	465309	0 %	0 %	25 %	75 %	374294464
13076	NC_016624	CCG	2	6	465314	465319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294464
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13080	NC_016624	CGA	2	6	465458	465463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294464
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13083	NC_016624	CGG	2	6	465591	465596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_016624	G	6	6	465599	465604	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_016624	CCA	2	6	465669	465674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294465
13086	NC_016624	CAG	2	6	465682	465687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294465
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13088	NC_016624	GCC	2	6	465707	465712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294465
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13090	NC_016624	TCA	2	6	465792	465797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294465
13091	NC_016624	CAG	2	6	465841	465846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294465
13092	NC_016624	CAG	2	6	465877	465882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294465
13093	NC_016624	GAA	2	6	465883	465888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294465
13094	NC_016624	TC	3	6	465891	465896	0 %	50 %	0 %	50 %	374294465
13095	NC_016624	CCA	3	9	465897	465905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294465
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13099	NC_016624	CAG	2	6	465991	465996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294465
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13101	NC_016624	CGG	2	6	466016	466021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294465
13102	NC_016624	CAG	2	6	466024	466029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294465
13103	NC_016624	TCG	2	6	466046	466051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294465
13104	NC_016624	CG	3	6	466050	466055	0 %	0 %	50 %	50 %	374294465
13105	NC_016624	GGGC	2	8	466064	466071	0 %	0 %	75 %	25 %	374294465
13106	NC_016624	GCCAGC	2	12	466100	466111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374294465
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13110	NC_016624	GCA	2	6	466227	466232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294465
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13120	NC_016624	CGG	3	9	466518	466526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294465
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13228	NC_016624	GCAG	2	8	469682	469689	25 %	0 %	50 %	25 %	374294466
13229	NC_016624	GTT	2	6	469710	469715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294466
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13232	NC_016624	GCA	2	6	469772	469777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294466
13233	NC_016624	CGCGCT	2	12	469790	469801	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374294466
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13236	NC_016624	GTCC	2	8	469925	469932	0 %	25 %	25 %	50 %	374294466
13237	NC_016624	CGA	2	6	469967	469972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294466
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13240	NC_016624	CCA	2	6	470060	470065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294466
13241	NC_016624	CGA	2	6	470078	470083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294466
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13243	NC_016624	GCA	2	6	470132	470137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294466
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13281	NC_016624	GGC	2	6	471687	471692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13283	NC_016624	GCCA	2	8	471709	471716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13284	NC_016624	CTG	2	6	471767	471772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294467
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13353	NC_016624	GC	4	8	473941	473948	0 %	0 %	50 %	50 %	374294468
13354	NC_016624	GGC	2	6	473959	473964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294468
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13356	NC_016624	CGC	2	6	474061	474066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294468
13357	NC_016624	GATCG	2	10	474085	474094	20 %	20 %	40 %	20 %	374294468
13358	NC_016624	CGGCT	2	10	474107	474116	0 %	20 %	40 %	40 %	374294468
13359	NC_016624	CGG	2	6	474124	474129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13361	NC_016624	CGGC	2	8	474161	474168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.